A császármetszés az egyik legtöbbet végzett műtét a világon, és nagyon sokszor ennek a beavatkozásnak köszönheti az életét a szülő nő és a magzat is. A rutinszerűség azonban nem jelenti azt, hogy a műtétnek nincsenek kockázatai. Természetesen a rizikó nagymértékben függ attól, hogy milyen körülmények között, milyen szakemberek segítségével végzik a műtétet.
A császármetszés jóval nagyobb veszéllyel jár az anyára nézve, mint a hüvelyi szülés. Ez utóbbinál a fejlett országokban 3.5 a halálozási arány 100 ezer szülésre vetítve, a császármetszésnél azonban ez az arány ennek négyszerese is lehet. Mint minden hasi műtétnél, a császármetszésnél is megvan a kockázata a seb elfertőződésének, a hegképződésnek , a heggel összefüggő sérvnek vagy a varrat szétnyílásának. Amennyiben a császármetszés sürgősségi beavatkozás, a kockázatok még nagyobbak lehetnek, például azért, mert a páciens gyomra nem üres és ez veszélyesebbé teszi az altatást.
A császármetszés egyaránt kockázatos lehet az anyára és a gyermekre nézve
A császármetszésen átesett nők számára valamivel kockázatosabbak lehetnek a későbbi várandósságok, különösen akkor, ha több császármetszés követi egymást. A császármetszés utáni hüvelyi szülés (VBAC - vaginal birth after Caesarean section) nem lehetetlen, de nagy körültekintést igényel a szülést készítő szakemberektől és az anyától egyaránt.
A császármetszéssel szült nők gyakrabban tapasztalhatnak meg szülés utáni depressziót, és a traumás szülésélmény feldolgozása is nehezebb lehet a számukra.
A császármetszés magzatra vonatkozó kockázatai nagyban függnek attól, hogy mikor végzik el a műtétet. Amennyiben a 39. terhességi hét előtt végzik el a műtétet, az újszülött halálozási veszélyei a többszörösére nőnek, és az is valószínűbb, hogy az újszülöttnél egészségügyi komplikációk, például légzési nehézségek lépnek fel. A 37-38. héten császármetszéssel világra jövő újszülötteknek több időt kell kórházban tölteni, mint a később megszületőknek.
A császármetszés hosszú távú következményeiről számos kutatás született, de ezek eredményei gyakran ellentmondásosak és sok vitát kavarnak. A császármetszést összefüggésbe hozták már olyan problémákkal, mint a tanulási zavarok , az allergia vagy a bélrendszeri gondok.
