Az elmúlt évtized során számos patogén baktérium teljes genomját térképezték fel a kutatók.
Az egyre növekvő genomikai adatok új utakat nyitnak meg a védőoltások és antibakteriális szerek kifejlesztésében.
A védőoltások kifejlesztésének egyik hatékony módja a reverz vakcinológia, melynek során a géntérkép felhasználásával azonosítják a potenciális antigéneket. Ennek segítségével rövidebb idő alatt tudnak védőoltásokat kifejleszteni, mint az akár évtizedeket is igénybe vevő, hagyományos (biokémiai, immunológiai, mikrobiológiai) módszerekkel. A Neisseria meningiticlis esetében például a genom ismeretében 18 hónapon belül mintegy 600 potenciális antigént azonosítottak. A kiválasztott fehérjéket ezután biotechnológiai úton előállították, majd egereket immunizáltak vele, így jutottak el a vakcina készítésére alkalmas antigénekhez. Ezzel a módszerrel nemcsak baktériumok, hanem vírusok esetében is sikerült már védőoltást kifejleszteni, pl. a hepatitis C vírus ellen. A reverz vakcinológia segítségével előállított védőoltások egy része már klinikai kipróbálás alatt van.
Az egyes fajokhoz tartozó különböző baktériumtörzsek genomjának szekvenálása során derült fény arra, hogy a génállomány jelentős része, mintegy 2 0-3 5 %-a különbözhet fajon belül is. Egy faj teljes génrepertoárja három részre osztható: a mag-genom, amely mindegyik törzsben változatlanul jelen van, a "nélkülözhető genom", amely megtalálható néhány, de nem az összes törzsben, és a törzs-specifikus gének, amelyek csak egy adott törzsre jellemzőek. Bár a mag-genomból remélhetnének univerzálisan alkalmazható vakcina-jelölteket, sajnos nagyon valószínű, hogy ezek nem váltanak ki immunreakciót a patogénekben. A "nélkülözhető-genom" ezzel ellentétben felbecsülhetetlen forrása az új antigéneknek, melyek bár csak a baktériumtörzsek egy részében vannak jelen, de nagyon fontos, virulenciával összefüggő funkciókat kódolhatnak, ugyanakkor más antigénekkel kombinációban széles immunválaszt hozhatnak létre.
Muzzi, A. et al.: The pan-genom: towards a knowledge-based discovery of novel targets for vaccines and antibacterials. Drug Discovery Today 12, 42 9-4 39, 2007.
MKM
Gyógyszerészet
(2007.08.03. 09:27)
