A bélcsatornában egészséges körülmények között is jelenlévő baktériumok összessége. A bélcsatorna vége felé számuk a baktériumok száma jelentősen megnövekszik. Bizonyos körülmények között ezek a normálisan betegségeket nem okozó baktériumok is gyorsan terjedő járványokat okozhatnak.
